クリニック・整骨院のキャッシュレス決済は？医療特別料率と総額
結論：医療法上の病院・診療所は、STORESの医療特別料率（クレジット1.30%〜、月額0円）を使える可能性があり、クレジットの比率が高いクリニックでは手数料が大きく下がります。整骨院・接骨院はこの条件に当てはまらないため、一般の料率で比べます。
窓口の自己負担分（月200万円・キャッシュレス40%）の計算では、医療特別料率を当てたSTORESが1年目・2年目とも最も少額でした。
次にやること：自院が「医療法上の病院・診療所で、主な事業が診療」に当たるかを確認し、STORESの専用フォームの条件を読みます。
クリニックの窓口なら1年目はいくら？
窓口の自己負担分200万円・キャッシュレス40%（クレジット80・電子マネー10・QR10）・レジ1台の場合です。STORESには医療特別料率（クレジット1.30%）を当てています。
| 順 | サービス・プラン | 1年目の総額 | 2年目の年額 | 決済手数料/年 | 初期・周辺機器 | 注意 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | STORES レジ＋STORES 決済 フリープラン（0円） | 319,898円 | 162,048円 | 162,048円 | 157,850円 | クレジット2.48%は対面キャッシュレス決済額が年間3,000万円未満などの条件／医療特別料率（クレジット1.3%〜。医療法上の病院・診療所が対象、申込フォームと審査あり）で計算／フリープランは2026年12月1日から決済手数料に1注文40円の加算（料金一覧ページの脚注とネットショップの料金ページに同じ注記。対面決済が対象かは注記のリンク先FAQで確認が必要で、計算に含まず） |
| 2 | Airレジ＋Airペイ Airレジ（0円）＋Airペイ | 382,802円 | 252,672円 | 252,672円 | 130,130円 | クレジット2.48%は決済手数料ディスカウントプログラム（エントリー制・適用条件あり。条件の詳細は公式ページに記載なし）。当サイトは「中小企業かつ年間3,000万円未満」で2.48%と仮定して計算。条件外は3.24%／カードリーダーは0円スタートプログラム（申込月の6か月後の月末までに審査通過）で0円。通常は27,720円 |
| 3 | Square（POSレジ＋決済） Square POSレジ（0円）＋Square リーダー | 389,510円 | 254,400円 | 254,400円 | 135,110円 | クレジット2.5%は中小企業の定義に当てはまり、年間キャッシュレス決済額3,000万円未満などの条件（登録が必要） |
| 4 | スマレジ＋スマレジ・PAYGATE スタンダード（0円）＋PAYGATE＋計算に入らない費用あり | 411,698円 | 241,968円 | 202,368円 | 169,730円 | PAYGATEのクレジット1.98%〜は条件あり（直近1年のVisa・Mastercard合計売上2,500万円以内、中小企業の定義に該当、対象外業種でない、上場企業グループ・上場企業のFC加盟店でない、新規加盟店）。年間3,000万円の条件は公式ページに記載がないため、Visa・Mastercard2,500万円以内なら1.98%で計算。ブランド別の料率は問い合わせ／振込手数料の金額が公式ページに記載なし（計算に含まず）／スタンダードは1店舗のみ・端末の追加不可／PAYGATEの決済端末は料金欄に39,600円（税込）、別の箇所に「端末0円」の案内あり（条件は公式で要確認） |
| — | ユビレジ プレミアムプラン（月6,900円〜税抜）＋計算に入らない費用ありレジのみ | 221,210円 | 91,080円 | 0円 | 130,130円 | 表示は税抜の「〜」価格（ここでは×1.1で計算）。初期費用・機器代は公式ページに金額の記載なし／決済は別契約（連携する決済サービスの手数料は計算に含まず） |
決済だけで比べると次のとおりです。
| 順 | 決済サービス・プラン | 1年目 | 2年目 | 決済手数料/年 | 振込手数料/年 | 注意 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | STORES レジ＋STORES 決済 フリープラン（0円） | 189,768円 | 162,048円 | 162,048円 | 0円 | クレジット2.48%は対面キャッシュレス決済額が年間3,000万円未満などの条件／医療特別料率（クレジット1.3%〜。医療法上の病院・診療所が対象、申込フォームと審査あり）で計算／フリープランは2026年12月1日から決済手数料に1注文40円の加算（料金一覧ページの脚注とネットショップの料金ページに同じ注記。対面決済が対象かは注記のリンク先FAQで確認が必要で、計算に含まず） |
| 2 | stera pack（三井住友カード） stera pack（端末0円・14か月目から月3,300円） | 229,152円 | 265,452円 | 223,872円 | 5,280円 | スモールビジネスプラン（Visa・Mastercard1.98%、JCB等2.48%）は中小企業の定義に当てはまる小規模事業者向け（たばこ店・百貨店・旅行代理店・宿泊施設・運輸・不動産は対象外）。判定は直近1年のVisa・Mastercard売上2,500万円で、超えるとスタンダードプランに変わり、その後は売上に関係なくスタンダードの料率（年3,000万円の条件はないため、Visa・Mastercard2,500万円以内なら1.98%で計算）／月額は端末1台あたり。利用開始月から13か月目まで0円、14か月目から発生（三井住友銀行の紹介ページ。三井住友カードのページは「1年目無料・2年目以降」と表記）。直近1年の累計キャッシュレス売上3,000万円以上なら永年無料／契約期間は3年。解約申出から45日以内に端末を返却しないと端末1台あたり最大88,000円（税込）の違約金 |
| 3 | Airレジ＋Airペイ Airレジ（0円）＋Airペイ | 252,672円 | 252,672円 | 252,672円 | 0円 | クレジット2.48%は決済手数料ディスカウントプログラム（エントリー制・適用条件あり。条件の詳細は公式ページに記載なし）。当サイトは「中小企業かつ年間3,000万円未満」で2.48%と仮定して計算。条件外は3.24%／カードリーダーは0円スタートプログラム（申込月の6か月後の月末までに審査通過）で0円。通常は27,720円 |
| 4 | Square（POSレジ＋決済） Square POSレジ（0円）＋Square リーダー | 259,380円 | 254,400円 | 254,400円 | 0円 | クレジット2.5%は中小企業の定義に当てはまり、年間キャッシュレス決済額3,000万円未満などの条件（登録が必要） |
| 5 | 楽天ペイ（実店舗決済） ライトプラン（月額0円）＋計算に入らない費用あり | 252,768円 | 252,768円 | 252,768円 | 0円 | ライト・スタンダードは中小加盟店向け（事業者単位で年間キャッシュレス決済3,000万円以下、中小企業の定義に該当、上場企業グループ・FC店でない、対象外業種でないなど。スタンダードは2年以上の継続利用が条件）。電子マネーは交通系・Edy等2.95%（税抜）、iD・QUICPay3.24%。QRは楽天ペイ2.254%（税抜）など。計算は2.95%（税抜）＝3.245%で／振込手数料の金額が公式ページに記載なし（計算に含まず）／決済端末の価格が公式ページに記載なし（計算に含まず）／決済端末（楽天ペイ ターミナル・カードリーダー）の価格は公式ページに記載なし |
| 6 | スマレジ＋スマレジ・PAYGATE スタンダード（0円）＋PAYGATE＋計算に入らない費用あり | 281,568円 | 241,968円 | 202,368円 | 0円 | PAYGATEのクレジット1.98%〜は条件あり（直近1年のVisa・Mastercard合計売上2,500万円以内、中小企業の定義に該当、対象外業種でない、上場企業グループ・上場企業のFC加盟店でない、新規加盟店）。年間3,000万円の条件は公式ページに記載がないため、Visa・Mastercard2,500万円以内なら1.98%で計算。ブランド別の料率は問い合わせ／振込手数料の金額が公式ページに記載なし（計算に含まず）／スタンダードは1店舗のみ・端末の追加不可／PAYGATEの決済端末は料金欄に39,600円（税込）、別の箇所に「端末0円」の案内あり（条件は公式で要確認） |
| — | PayPay（QRコード決済） ライトプランなし（1.98%税別）QRのみ | 20,909円 | 20,909円 | 20,909円 | 0円 | QRコード決済の分だけを計算（クレジット・電子マネーは別の決済サービスが必要） |
医療特別料率の条件は？
STORESの医療特別料率のページに書かれている条件です。
- 医療法第1条に定める病院・診療所で、主な事業が診療
- 薬局・動物病院・美容クリニックは対象外
- 対象の診療科：内科、外科・整形外科、皮膚科、眼科、歯科、その他（単科）
- 専用の申込フォームから申し込み、加盟店審査を通ること
- 既に使っている場合はサポートへの連絡で切替
- クレジット1.30%〜、交通系IC・iDは3.24%（電子マネー・QRは通常の率）
- 初期費用・固定費0円〜、解約手数料0円
整骨院・治療院なら？
整骨院・接骨院・治療院は医療法上の病院・診療所ではないため、一般の料率で比べます。窓口の売上80万円・キャッシュレス30%の例です。
| 順 | サービス・プラン | 1年目の総額 | 2年目の年額 | 決済手数料/年 | 初期・周辺機器 | 注意 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Airレジ＋Airペイ Airレジ（0円）＋Airペイ | 154,979円 | 80,179円 | 80,179円 | 74,800円 | クレジット2.48%は決済手数料ディスカウントプログラム（エントリー制・適用条件あり。条件の詳細は公式ページに記載なし）。当サイトは「中小企業かつ年間3,000万円未満」で2.48%と仮定して計算。条件外は3.24%／カードリーダーは0円スタートプログラム（申込月の6か月後の月末までに審査通過）で0円。通常は27,720円 |
| 2 | Square（POSレジ＋決済） Square POSレジ（0円）＋Square リーダー | 160,420円 | 80,640円 | 80,640円 | 79,780円 | クレジット2.5%は中小企業の定義に当てはまり、年間キャッシュレス決済額3,000万円未満などの条件（登録が必要） |
| 3 | STORES レジ＋STORES 決済 フリープラン（0円） | 182,699円 | 80,179円 | 80,179円 | 102,520円 | クレジット2.48%は対面キャッシュレス決済額が年間3,000万円未満などの条件／フリープランは2026年12月1日から決済手数料に1注文40円の加算（料金一覧ページの脚注とネットショップの料金ページに同じ注記。対面決済が対象かは注記のリンク先FAQで確認が必要で、計算に含まず） |
| 4 | スマレジ＋スマレジ・PAYGATE スタンダード（0円）＋PAYGATE＋計算に入らない費用あり | 216,611円 | 102,211円 | 62,611円 | 114,400円 | PAYGATEのクレジット1.98%〜は条件あり（直近1年のVisa・Mastercard合計売上2,500万円以内、中小企業の定義に該当、対象外業種でない、上場企業グループ・上場企業のFC加盟店でない、新規加盟店）。年間3,000万円の条件は公式ページに記載がないため、Visa・Mastercard2,500万円以内なら1.98%で計算。ブランド別の料率は問い合わせ／振込手数料の金額が公式ページに記載なし（計算に含まず）／スタンダードは1店舗のみ・端末の追加不可／PAYGATEの決済端末は料金欄に39,600円（税込）、別の箇所に「端末0円」の案内あり（条件は公式で要確認） |
| — | ユビレジ プレミアムプラン（月6,900円〜税抜）＋計算に入らない費用ありレジのみ | 165,880円 | 91,080円 | 0円 | 74,800円 | 表示は税抜の「〜」価格（ここでは×1.1で計算）。初期費用・機器代は公式ページに金額の記載なし／決済は別契約（連携する決済サービスの手数料は計算に含まず） |
STORESは整骨院などの「ほかの特別料率対象業種」があるとしていますが、率は公式ページに載っていません。問い合わせで確認してください。
クリニック・整骨院で確認したいことは？
- 電子カルテ・レセプトコンピュータと決済端末の連携
- 自由診療・物販の売上の扱い
- 返金（取消）の手順
- 入金サイクル（入金サイクル）
- 予約システムとの連携
自分の条件（業種・月の売上・キャッシュレス比率・決済の種類・台数・必要な機能・補助金）での1年目の総額は、トップの計算ツールで出せます。入力内容は送信されません。
よくある質問
- 医療特別料率は誰が使える？
- STORESの医療特別料率（クレジット1.30%〜）は、医療法第1条に定める病院・診療所で、主な事業が診療のところが対象です。薬局・動物病院・美容クリニックは対象外で、専用フォームでの申込と加盟店審査があります。
- 整骨院・接骨院は医療特別料率の対象？
- 整骨院・接骨院は医療法上の病院・診療所ではないため、STORESの医療特別料率の条件には当てはまらないと考えられます。STORESは整骨院などのほかの特別料率対象業種があるとしていますが、率は公式ページに書かれていません。問い合わせで確認してください。
- 窓口のどの金額で計算する？
- キャッシュレス決済の手数料は、窓口で受け取る自己負担分（自由診療を含む）の決済額にかかります。保険者に請求する分は決済の対象ではありません。
出典・確認した一次情報
- STORES 医療特別料率：https://stores.fun/pricing/medical
- STORES 決済：https://stores.fun/payments
- 三井住友カード 加盟店プラン：https://www.smbc-card.com/kamei/start/plan.jsp
- Square 決済手数料：https://squareup.com/jp/ja/payments/our-fees
- Airペイ：https://airregi.jp/payment/